Os estudantes pré-selecionados terão 72 horas para apresentar a documentação nas respectivas universidades. O objetivo dessa etapa é comprovar as informações prestadas no ato de inscrição e a participação em  eventual processo seletivo próprio da instituição, quando for o caso. Após esse primeiro contato, as IEs informarão a efetivação da matrícula dos alunos e ficarão responsáveis de orientar os jovens sobre o calendário letivo.

No caso do não preenchimento do total de vagas por curso, turno e instituição na primeira divulgação dos resultados, serão realizadas novas convocações no prazo mínimo de até 72 horas – após o período disponibilizado para matrículas. O processo seletivo pode chegar até 5 chamadas sucessivas. Vale ressaltar que as edições do Prouni Recife são guiadas pelo critério classificatório. Isso quer dizer que as vagas oferecidas para os diversos cursos e respectivos turnos serão preenchidas pelos candidatos mais bem classificados, até o limite de vagas fixadas para cada curso, desde que preencham todos os requisitos do programa.

Na hipótese de notas idênticas, o desempate entre os estudantes seguirá a seguinte ordem de critérios: nota da redação; nota da prova de Linguagem, Códigos e suas Tecnologias; nota da prova de Matemática e suas Tecnologias; nota da prova de Ciências da Natureza e suas Tecnologias; e nota da prova de Ciências Humanas e suas Tecnologias.